Выборгский филиал федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Российская академия народного хозяйства и государственной службы при Президенте Российской Федерации» существует с 1993 года, когда по инициативе Северо-Западной академии государственной службы и при поддержке Выборгской городской администрации, было открыто Выборгское отделение Северо-Западной академии государственной службы. В 2010 году в соответствии с Указом Президента Российской Федерации «Об образовании Российской академии народного хозяйства и государственной службы при Президенте Российской Федерации» № 1140 от 20 сентября 2010 года, в целях совершенствования учебной, научной и организационно-методической базы, филиал СЗАГС в г. Выборге (Ленинградской области) был реорганизован в Выборгский филиал «Российской академии народного хозяйства и государственной службы при Президенте Российской Федерации», территориально обособленное структурное подразделение, не имеющее статус юридического лица.