Уже больше 30 лет Институт занимается разработкой научных основ реализации государственной политики в сфере здравоохранения, занимается научным обоснованием развития системы охраны здоровья населения, организации и информатизации здравоохранения. Институт является координирующим центром трех федеральных проектов – по борьбе с сердечно-сосудистыми заболеваниями, по борьбе с онкологическими заболеваниями, развитие экспорта медицинских услуг.
Институт не только научно обосновывает стратегические направления развития системы здравоохранения, но и готовит практические рекомендации (программы, методики, нормативы) и варианты управленческих решений. Он отвечает за разработку новых форм организации различных видов медицинской помощи и методов управления, например, разрабатывает информационные системы и модели для текущих и долгосрочных задач управления объектами здравоохранения на базе системного анализа и современных компьютерных технологий. На внедрение результатов в практику Институт влияет путем подготовки соответствующих нормативных документов.
Также среди задач института – научное обоснование кадровой политики в здравоохранении, изучение тенденций в изменении состава, структуры и обеспеченности населения медицинскими кадрами. Институт берет на себя все виды постдипломной подготовки специалистов по своему профилю (обучение в ординатуре, аспирантуре, докторантуре).
Отдельное направление работы – медицинская статистика: Институт участвует в проведении медико-демографических и социально-гигиенических исследований состояния здоровья и воспроизводства населения в различных регионах России. Он собирает, обрабатывает и анализирует статистические данные.
Наконец, важная задача - сотрудничество с российскими и международными организациями по проведению совместных научных исследований и обмену опытом в области организации и информатизации здравоохранения.