Астраханский институт рыбного хозяйства был основан приказом Народного Комиссариата внешней и внутренней торговли в 1930 г., в 1994 г. – получил статус университета и был преобразован в Астраханский государственный технический университет (АГТУ).
Функции и полномочия учредителя от имени Российской Федерации осуществляет Федеральное агентство по рыболовству.