К 1982 году Эгейский университет был одним из крупнейших университетов Турции с 19 факультетами, 9 младшими школами типа колледжа и 8 институтами. В том же году часть университета была выделена в новый университет Dokuz Eylül University (Университет Докуз Эйлюл). После разделения в Эгейском университете было 7 факультетов, 3 младших колледжа и около 9000 студентов. В настоящее время он состоит из 15 факультетов, 6 младших колледжей, 10 профессионально-технических училищ, 9 институтов и 36 исследовательских центров.