В соответствии с решением ЦК КПСС и Совета Министров СССР для подготовки производства судоремонтных заводов ВМФ, приказом ГК ВМС от 24 августа 1954 ., было создано Центральное Конструкторско-Технологического Бюро ВМС в составе Главного управления судоремонтных заводов Военно-Морского Флота (ГУСРЗ ВМФ).
В целях конструкторско-технологического обеспечения ремонта ПЛ с ядерными энергетическими установками из состава ЦКТБ ВМФ в 1959 году было выделено 330 СКТБ (в\ч 26920). В 1980 г., ЦКТБ ВМФ и 330 СКТБ были сведены в единый 51 Центральный Конструкторско-Технологический Институт. Численность работающих составила 1000 человек.
С 2009 г., институт преобразован в ОАО «51 ЦКТИС».
С 2016 г., институт переименован в АО «51 ЦКТИС».
В течении всего периода своей деятельности Институт комплексно обеспечивал перспективную подготовку производства СРЗ ВМФ к ремонту новых кораблей и судов ВМФ, в том числе:
На базе функционирующей системы решением ВМФ создан фонд технических условий на продукцию,разработанную по заказам Минобороны России для нужд ВМФ, поставка или ремонт которой является предметом государственного оборонного заказа. Фонд содержит документацию на 800 проектов кораблей, судов и иных плавсредств и превышает 4 миллиона единиц хранения документации на корабли, суда, их составные части и комплектующие их изделия.
Создана система ценообразования в судоремонте ВМФ, разработано для СРЗ ВМФ более 100 сборников норм времени на судоремонтные работы, ведомственные калькуляционные нормативы и др. Для большинства СРЗ ВМФ институтом проектировались технологические части специальных цехов и участков.
Институт проводил большую работу по внедрению передового опыта ремонта. С 1961 по 2010 года институт издавал производственный сборник «Технология судоремонта», который пользовался большим спросом у предприятий различных ведомств. Всё это позволило институту заслуженно именоваться Головной организацией ВМФ по судоремонту. Участвуя под руководством органов военного управления в формировании и проведении единой технической политики в области технического обслуживания и ремонта, институт и сегодня по праву в числе ведущих предприятий военного судоремонта. С вхождением в состав института с 2012 года коллектива конструкторов легендарного 170 ОКТБ потенциал организации существенно возрос. Сегодня на институт решением Минобороны России возложены дополнительные функции – функции проектанта кораблей и судов ВМФ иностранной постройки.
Авторитет института сегодня подтверждается также: